RR9系列讀寫器的透明操作功能，是為了配合未來標簽的新增功能以及各廠商標簽的特色功能而配備的高端特性。

    當讀寫器工作在透明命令操作模式下，讀寫器實際上相當于一個射頻的數據引擎，它將控制器或主機的數據流按ISO15693協議的數據包格式封裝后傳遞到標簽，然后按ISO15693協議將標簽返回的數據解調拆包后傳回控制器或主機，解調和拆包的時序可以按需要指定。

    當前以及未來ISO15693標簽的新增功能和特色功能，通過透明命令操作，RR9系列讀寫器可以充分支持。例如，NXP（前身PHILIPS半導體）公司的ICODE2芯片提供的EAS功能，就可以通過透明命令操作實現。